Su trayectoria comienza con la agrupación colombiana San Alejo, con la que obtuvo una gran cantidad de reconocimientos y premiaciones, llevando su música a varios países de Latinoamérica y Estados Unidos. Con esta banda recibió numerosas distinciones a mencionar: Discos de Oro por ventas de sus tres trabajos discográficos editados: “Sanalejo” (2003 Universal Music), “Alma y Locura” (2005 Emi Music) y “No Lo hagas” (2007 Emi Music). Este último, record de ventas en su país natal, logró posicionar más de 5 sencillos en diferentes radios de Colombia y Latinoamérica. A su vez, San Alejo fue acreedor de un Premio de la Cadena 40 Principales, España, como “Mejor Artista de Colombia 2007”; tres Premios Shock en Colombia como “Artista revelación 2003”, “Artista del año 2005” y “Mejor artista Pop 2008”;y unPremio Terra en Estados Unidos a “Artista Revelación del Año 2007”.
Extensas giras por varios países como, Estados Unidos, Ecuador, Venezuela y su natal Colombia, los posicionaron como un referente musical del pop/rock latino, identificado con una generación joven que vibró al ritmo de los temas: “Mejor que tú no hay nada”, “Barman”, “Me Gusta”, “Ya tú Ves”, “Yo No te Olvido”, entre otros compuestos por Sebastián Yepes.
En el 2008, después de 9 años como vocalista de Sanalejo, Sebastián Yepes se separa de la banda y decide dar inicio a su carrera como solista.
A principios de febrero de 2009, Sebastián Yepes se instala en Medellín, Colombia, para comenzar la grabación de su primer trabajo como solista, “De lo oscuro a lo puro”,junto al excelente productor y músico Fernando "Toby"Tobón, quien comenzó su carrera como guitarrista de la legendaria banda Ekhymosis, y quien actualmente trabaja con Juanes como guitarrista y director de su banda. “Toby” ha producido discos y canciones para artistas reconocidos mundialmente como: Santana (álbum Shaman), Diego Torres, Natalia Oreiro y David Bisbal.
“No me veré caer”, primer sencillo del álbum “De lo oscuro a lo puro”, fue estrenado a mediados de 2009, teniendo una amplia acogida en las principales emisoras del país. El videoclip de este tema, grabado bajo el concepto de Flashmob¸ o multitud instantánea, fue lanzado a finales de este mismo año. Este video reflejaba claramente el carácter urbano, carismático y poco paradigmático que Sebastián Yepes le ha querido dar desde el principio a la promoción de su trabajo.
Una primera edición de “De lo oscuro a lo puro”fue lanzada en septiembre de 2009, teniendo una maravillosa recepción entre los seguidores de Sebastián Yepes, quienes por meses acompañaronal artista en su travesía de vender los discos personalmente a domicilio y en los parques más populares de las principales ciudades del país.
Acompañando la presentación de su primer álbum como solista, en el 2009 Sebastián Yepes participó en eventos como el Concierto Nuestra Tierra de La Mega, Evento 40 de 40 Principales, y Concierto Tú Live organizado por la Revista Tú. A su vez, este año obtuvo su primer galardón como solista, recibiendo el Premio Shock a “Mejor Artista Nuevo 2009”.
Sebastián Yepes culminó el primer año de su carrera como solista, firmando contrato de management exclusivo con RLM Colombia, filial de RLM en Latinoamérica.